气功流派的形成,早在春秋战国已露端倪。到了汉代,由于道教的成立,佛教的传入,医家的成熟,门派阵营越来越分明,至唐代形成了门派林立的局面。且各派为求生存发展,互相争斗,力求压倒他派。抑或物极必反,分久必合,唐宋以来、许多气功学者如司马祯、李含光、王重阳等提出儒、道、佛同源观点后,气功出现了万法归一之势,儒、道、佛开始相互融汇,走向合流。
如儒家取佛家禅定理论及静坐之法,又纳道教部分养生术于修身之中;道家取佛家禅定理论和儒家伦理思想,融于自己的功理之中,内丹体系,就是道教广纳博取的优秀代表。佛教也不例外,天台宗智凯大师著作中的六字气诀,是地道的道家功法。朋朝以后,气功流派合流之势更加明显,此时还出规了许多吸收三教功法、功理之长的气功著作和包容一切的混元理论。
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